시골 마을에서 정미소를 운영하는 지적장애인 석구(김대명)는 동네 주민들과 친하게 지낸다. 마을 성당의 신부(김의성) 역시 지능이 조금 모자라도 마음이 착한 석구를 아끼며 잘 보살핀다. 어느 날 마을에 가출 소녀 은지가 나타난다. 석구는 아빠를 찾아 헤매는 은지와 친구가 되지만 어느 날 밤 정미소에서 불미스러운 사건이 벌어진다. 은지가 머물던 쉼터의 선생(송윤아)은 석구가 은지에게 성추행을 했다고 확신하지만 신부는 석구가 그럴 리 없다며 옹호한다. 진실은 어디에 있는 것일까? 진실이 무엇이건 석구는 지적장애인이기에 자신을 제대로 변호할 능력이 없다. 평소 석구에게 살갑게 대했던 마을 주민들도 그에게 등을 돌리고, 법은 석구와 은지가 다시 만나는 걸 허용하지 않는다. 영화는 석구를 죄인으로 모는 가혹한 선입견을 비판한다. 성폭력이 사회적 의제로 떠오른 지금, <돌멩이>가 던지는 질문은 논쟁을 불러일으킬 만하다. 당신은 석구를 비난하는 선생의 편인가? 석구를 옹호하는 신부의 편인가? (남동철)