현재 미군기지가 주둔하고 있는 일본 열도 최남단의 섬 오키나와는 2차 세계대전이 끝나갈 무렵, 연합군으로부터 일본을 지키는 방어선의 역할을 했다. 연합군이 상륙하고 그 유명한 오키나와 전투를 거치며 20만여 명의 일본인이 목숨을 잃은 곳이기도 하다. 역사적으로 잘 알려진 이 전투의 이면에는 일본 역사 어디에도 공식적으로는 존재하지 않는 비밀 전투가 계속되고 있었다. 게릴라부대를 통해 전개된 이 비밀전투의 주력부대는 10대 초반의 어린 소년병들과 전염병인 말라리아의 유행, 그리고 민간인으로 위장하고 다른 민간인을 살해하는 군인들이었다. 이 모든 것은 수수께끼의 ‘나가노 학교’를 막 졸업한 젊은 엘리트 장교가 기획한 음모에서 비롯되었다. 다큐멘터리 <오키나와의 소년병>은 일본 정부가 감추고 있는 역사적 비극을 밝히기 위해 감추어진 비밀들을 하나하나 찾아내어 연결한다. 이것은 오키나와 전투 이면에 존재하는 금기를 깨려는 작업인 동시에 일본의 재무장화를 위한 최근의 시도에 경종을 울리려는 것이기도 하다.